该片的舞台是私立学院学员高等部，主人公是对谜题十分着迷并自信逢谜必破的高一学生大门界人。 有一天，大门界人受到学生会长邀请，同青梅竹马少女野叶一起前往学校附近的遗迹解“不能解开之谜”，原来这是一个由神秘智能集团制造出的能危机人类生命的“贤者之谜”。可是热爱解谜的大门硬要作出挑战。在得到某件“物件”之后，大门即被点名成为所谓的“解答者”。 从此，大门界人就与野叶和其他充满个性的解答者一起挑战潜藏于世界各地的“贤者之谜”。