2017年，地球受到Blue的袭击，只有不到一千万人能逃到瑟坎多亚斯特号（而且只有经过挑选的人才有优先权登陆），而且将抛弃在地球上的人视为“已死亡”。2029年，部队在地球上发现了sleeper的相关资料。2031年，经研究后得知sleeper的秘密，并打算利用他们进行反击，随后实行回收sleeper的计划。　　在国立免疫研究所经过与Blue的战斗后，格兰素小队成功救出sleeper的幸存者祐司，便立即前往太空港准备返回瑟坎多亚斯特号。但在太空港遭到Blue的袭击，形势不利下被迫放弃太空港，负伤的队长罗伯特带领仅存的队员裘依、玛琳，..