动画片向日葵第二季全集又名忍者少女第二季故事以以学校被入侵，学生们的战斗和逃亡和破解阴谋的危机生活为主。这里是充满了日本风情的偏僻乡村——霞高原町，俗称“霞之里”。在村里有两所极其特殊的忍者院。某日，一女一男造访了这个村子。其中一个是为了与自己所憧憬的忍者“市川电藏”见面并拜之为师而入读“私立志能备学园”的女孩子。而另外一个男性则是以内不小心在旅行路途被骗走了借金而不得不在村里的学校作为新上任的老师一边上课一边尝还金钱的万里小路隼人。这两人在“霞之里”的邂逅是偶然还是必然？他们认识了霞之里中各色各样的人们，并且一起经历着学院生活和灾..