西历2225年，宇宙空间站“利柏.迪尔塔”是这个故事所发生的一切的开端。数百名的学员，为了成为专业宇航员而到达“利柏.迪尔塔”接受教官们的培训。但却因为被一股不知名的势力袭击而导致“利柏.迪尔塔”开始向盖多路托之海沉没。而教官们在保护学员的同时，不幸全部牺牲。 就这样幸存的487名青年学生在慌乱之中搭乘上了潜藏在“利柏.迪尔塔”内部的，迷一般的“维亚级”潜艇“RYVAIUS（利维雅斯）”，开始了他们那充满坚辛以及留下了永远的无法抹去的回忆的万里长征之路。