U.C.0087年，一年战争结束后的第七年，地球联邦政府的私兵集团提坦斯开始对卫星施行残酷的制压。为了抵抗提坦斯，由联邦军费尼斯・霍拉准将创建的反地球联邦组织奥古，在化名为柯瓦特罗・巴基纳的夏亚・阿兹纳布尔带领下，坚持不懈地与其作斗争。少年卡缪・比丹从提坦斯中叛逃，在奥古的帮助下，成为宇宙巡航舰亚加马的成员。在提坦斯与哈曼领导的基奥军之间相互勾心斗角的战乱中，卡缪接二连三地失去了自己所爱的人，最后承受不住膨大化的NEWTYPE能力，精神开始崩溃。