第1集：龙魂胎动　曹操所率领的许昌学院。在曹操的心腹之一郭嘉，以及洛阳降军贾诩的计策下，以逆我者亡式的强硬手段，迅速扩张它在关东的势力。在此同时，成都学园的关羽和张飞，对许昌的称霸关东深感忧虑，莫不日日督促其首领刘备，可惜刘备却毫无战意…

第2集：魔王觉醒　曹操和夏侯惇，突然遭到了袁绍旗下予州斗士的袭击。两人虽然受了伤，不过最後还是击退了予州斗士。但是夏侯惇为了保护受伤的曹操，在战斗中被另一个刺客胡车儿射出的苦无刺瞎了一只眼睛。挚友的眼睛遭刺瞎，曹操於是激动的控制不了自己，让体内沈睡的龙觉醒了…

第3集：流血落泪　为了确认刘备的力量，来到成都学园的吕蒙，如其所愿的成功唤醒了潜伏於刘备体内的龙，因龙的觉醒而陷入失控状态的刘备，其压倒性的强大力量令吕蒙惊愕失措。吕蒙虽然达成了目的，但是司马徽的一句「看来你也养了只龙呢」，却让吕蒙难掩困惑的表情…

第4集：二龙邂逅　不知由何人所派遣来的刺客，在现场留下写著「宁」字的拐子，而这拐子则是杀了郭嘉的凶器。因此而认为是出自南阳学院四天王甘宁所为的曹操，於是下令夏侯惇攻打南阳。与孙策母女有交情的夏侯惇，听到贾诩说若是藉此打倒没有防备的孙策，觉得不以为然。

第5集：斗士无惨　著迷惑之心的吕蒙来到了吕布的墓前。这时许昌派来初中部唯一的特A级斗士典韦，前来袭击吕蒙夺取龙珠。典韦的突然现身使吕蒙陷入危机。而典韦对司马懿的忠诚心，引发出她令人害怕的力量，吕蒙也因此被逼入了绝境。此时，一位手持日本刀的斗士现身…。

第6集：逢遇卧龙　在吕蒙与典韦的战斗中，突然出现的成都学园斗士赵云，取走了吕蒙手中的龙珠。另一方面，关羽希望刘备会因龙珠的力量而使命运改变。司马徽却说不只需要龙珠更需要孔明的力量。於是，关羽决定亲自前往桃源院，确认孔明是否有引领成都的资格…。

第7集：关羽投降　为了抢龙玉，贾祤派夏侯渊突袭南阳，前来迎击的周瑜和乐就苦战于精通杀人术的夏侯渊，发现吕蒙和龙玉都不在南阳之后夏侯渊随即撤退。　就在这时夏侯惇被下赦令去成都捕抓关羽，夏侯惇作为指挥官，包括有着1800年前与关羽交战宿命的徐晃的许昌三柱神向程度进发。

第8集：小霸王散　未免刘备陷入危险的关羽向许昌投降。面对关于龙玉的严刑拷问，对刘备忠心不二的关羽丝毫不屈服。　这时被魔王控制的曹操出现，1800年前曹操渴望把关羽收于旗下而不得。关羽的灵魂也不发让魔王平息，于是司马懿更决心要得到龙玉。　另外一方面，为夏侯渊突袭南阳十分生气的孙策决定独闯许昌...

第9集：友义烕裂　单枪匹马杀入许昌的孙策销声匿迹。在这时南阳收到许昌的讨伐通知。在无法掩饰心中震撼的周瑜、乐就、吕蒙面前，南阳四天王的最后一人左慈登场。　在四天王讨论孙策的计划时，成都的使者，暗杀郭嘉的真正凶手，马谡出现。马谡表示关羽被许昌俘虏，成都和南阳已在同一战线，并提出与诸葛亮会谈。左慈接受了这一提案，但吕蒙对成都仍心怀不满。

第10集：公瑾流转　孙策的下落仍毫无消息，周瑜感到十分焦躁不安。于是焦躁愤怒的周瑜把矛头指向了煽动许昌的孔明酱。为了试探孔明的真正用意，周瑜决定亲自拜访成都。　在成都面前，成功离开许昌的关羽现身极力阻止周瑜，并把在许昌发生的事告诉了周瑜。在关羽的引导下，周瑜意识到不管孙策是生是死，他必须做的是继承孙策的意念。

第11集：斗士乱战　南阳成都联军来到了最终战的地点火烧过的废弃工厂。被关羽的话激励的周瑜决定加入战阵。不过应该已经回归成都的关羽却不见踪影。没有孙策与关羽的最终决战形势严峻。另一方面，销声匿迹的孙策正陷入假死状态。　被愤怒情绪支配的曹操完全被龙吞噬。为了让在龙的影响下暴走的孙策恢复神智，于吉冒着生命危险与其战斗着。

第12集：赤壁炎上（结局）　关羽及时赶到，南阳成都联军成功逆转形势。仅剩的许昌斗士司马懿看着形势已定于是最后一拼，被注入了魔王之力的司马懿竭尽全力召唤魔王曹操。红色的龙出现在天空，强大的最后BOSS魔王曹操登场。　曹操的红龙使刘备无法抑制体内的金龙而暴走，完全无法控制力量的刘备被曹操紧咬不放。一时间无术可施，就在这时...