故事讲述了纠合了炼金术中最高技术的产物人工生命体（怪物）Chemy，作为被保管在名为Ride Chemy Card的卡牌之中的101个生命体，但是，本应被慎重保管着的它们却突然从卡牌中冒出，一齐遭到释放。偶然被卷入该事件的主人公为高中生 · 一之濑宝太郎，被托付了假面骑士Gotchard的变身腰带Gotchar驱动器，与回收散落于世间的Chemy的使命。